Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms