Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms