Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C20orf27Q9GZN8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C20orf27Q9GZN8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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