Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD6

PRRG4, Transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRG4Q9BZD6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRG4Q9BZD6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms