Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms