Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR3CQ9BUI4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms