Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB6Q9BUF5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms