Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms