Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.2 ms