Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms