Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms