Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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