Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms