Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GIPC3Q8TF64 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms