Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms