Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8N9G6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8N9G6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8N9G6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms