Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms