Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRCQ7RTU9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms