Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms