Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms