Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q5VSD8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms