Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms