Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms