Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms