Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms