Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms