Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL392185.1-201ENST00000419620 395 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms