Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHKAPQ2M3C7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms