Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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