Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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RTN1Q16799 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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RTN1Q16799 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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RTN1Q16799 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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