Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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