Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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