Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NEDD8Q15843 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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