Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms