Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IHHQ14623 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IHHQ14623 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IHHQ14623 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IHHQ14623 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms