Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC3Q14574 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms