Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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