Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNC3Q14003 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms