Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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