Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms