Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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