Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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