Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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