Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL1Q13616 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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