Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms