Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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