Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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