Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms