Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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