Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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CHAF1BQ13112 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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CHAF1BQ13112 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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